qPCR

 Real-time PCR machine

Quantitative Polymerase Chain Reaction machine

Mesin qPCR (quantitative Polymerase Chain Reaction) terdiri dari Thermal Cycler yaitu suatu perangkat elektronik dengan filamen pemanas dan alat pendingin yang dapat menaikkan dan menurunkan suhu secara terkendali secara berulang-ulang dalam proses denaturation, annealing, dan extension dalam metode PCR (Polymerase Chain Reaction) ini.

Selanjutnya dengan menggunakan komponen LED (Light Emitting Diode) yang dikombinasikan dengan Photodiode yang ditempatkan pada masing-masing tabung spesimen dimana spesimen telah ditandai dengan fluorescent dyes (fluorophore), jumlah dari target DNA (Deoxyribose Nucleic Acid) yang akan dideteksi dapat diketahui.

Dye pada spesimen akan menghasilkan cahaya (fluorescent) jika terkena sinar lampu LED, dan cahaya fluorescent ini ditangkap oleh photodiode. Photodiode akan menghasilkan tegangan yang berbanding lurus dengan intensitas cahaya yang dihasilkan oleh fluorescent dyes pada spesimen dalam tabung. Besaran tegangan yang dihasilkan oleh photodiode akan dikonversikan oleh mikroprosesor menjadi data untuk dapat diolah lebih lanjut oleh komputer yang terkoneksi atau dapat ditampilkan langsung pada display yang terkoneksi dengan mikroprosesor.

    Pusat Mikroelektronika (PME) pada tahun 2020(BRIN) dan 2023 (LPIK-ITB), melakukan pengembangan qPCR dengan spesifikasi berikut:

 

Spesifikasi	Rincian
Thermal Cycler
Jumlah Spesimen	16 sampel Jenis tabung: 0,2ml individual tubes, strip tubes, Concave cap (rekomendasi) Sample volume: 10 – 20 uL
Akurasi Temperatur	0,2 ºC
Ramp Speed	1,6 ºC/detik
Typical Runtime	Cycle , step, total time Profil yang sudah pernah kita coba
Photo Detector
Compatible Reagent	SYBR Green (520 nm)
Fluorescence excitation	Blue LED F3 3mm, 455-460 nm range
Fluorescence detection	C12880MA Micro-Spectrometer, 400-600 nm range
Display	Resistive Touchscreen (single point) 5” 800×600 True Color
Dimensi	250mm x 370mm x 310mm (P x L x T)
Berat	6 kilogram
Daya	600W (50A, 12V)
Komunikasi	Ethernet WiFi (802.11 b/g/n)